Output format
på resultatsidan, för varje frågesekvens namnet, längden och denneurala nätverksutgångspoängen på vilken CTP/non-cTP-tilldelningen är baseradkommer att presenteras. Ju högre poäng, desto säkrare är nätverketatt denna sekvens innehåller en N-terminal kloroplasttransitpeptid (cTP).En potentiell cTP längd kommer också att presenteras, tillsammans med den motsvarandecleavage site poäng. Observera att förutsägelsen av transitpeptidlängden utförs även om dess närvaro inte förutses.Syftet är att ge maximal information i gränsfall.
om” detaljerad utgång ” väljs kommer neurala nätverkspoängen för varje Residue också att presenteras. Ju högre denna poäng desto säkrare ärnätverket att denna Rest är en del av en cTP. Ett derivat av nätverketscore presenteras också. Denna poäng används för att hitta det område där Cleavage site söks efter – nämligen bland de 40 rester som omger theresidue med den högsta derivatpoängen. Slutligen presenteras klyvningsplatsens poäng (CS-poäng) för varje Rest. Denna poäng beräknas från ascoring matrix härledd från en automatisk motiv hitta algoritm som kallas MEME. Cleavagesite-poängen definieras så att den förutsagda klyvningsplatsen är direkt terminal för den högsta poängresten inom 40-resterna. Således finns det en eller flera CS-poäng som råkar vara större än den föreslagna cTP-längden, men eftersom de ligger utanför 40-residuerna runt den högsta derivatpoängen är den presenterade cTP-längden fortfarandevad Klorop anser vara den mest sannolika presequenslängden(dvs. motsvarandetill den mest sannolika klyvningsplatsen).
