Klinisk prestanda för Roche Cobas 4800 HPV-Test | Jiotower

TEXT

humant papillomvirus (HPV) är ett av de vanligaste sexuellt överförda virusen över hela världen och en stor bidragsgivare till cancer, vilket orsakar nästan 60 000 nya cancerfall per år i Europa (1) och leder till utveckling av livmoderhalscancer hos kvinnor. HPV16 och HPV18 är de mest cancerframkallande (2, 3), som cirka 70% av alla livmoderhalscancer närvarande med HPV16 eller hpv18 infektioner (4). Nästan 30% av livmoderhalscancer missas av initial cervikal cytologi screening (5), så exakta och objektiva tester för HPV-associerad livmoderhalscancer som använder mer känsliga molekylära tekniker är nödvändiga för att ge effektiv förebyggande och behandling för att minska framtida risker och förekomst av livmoderhalscancer.

Roche Cobas 4800 HPV-test (Cobas) är en ny molekylär metod baserad på realtids-PCR (RT-PCR) (6, 7), med ett helautomatiskt system som möjliggör snabb och effektiv provbehandling. Cobas kan upptäcka HPV16, HPV18, 12 andra högrisk HPV (hrhpv) (HPV31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59, -66, och -68, som ett poolat resultat), och kontroll av OC-globin oberoende i samma PCR. Det primära syftet med Vår studie var att utvärdera de tekniska och kliniska prestandaegenskaperna hos Cobas. Livmoderhalsprover från 6 056 kvinnor som hänvisades till Institutionen för patologi vid Icahn School of Medicine vid Mount Sinai för rutinundersökning av livmoderhalsskador mellan November 2011 och februari 2012 samlades i ett vätskebaserat cytologimedium (PreservCyt; Hologic, Marlborough, MA) och lagras vid 4 msk C tills användning.

hundra åttio prover testades för hrhpv-genotyper genom både Roche Cobas 4800 HPV-test och Digene Hybrid Capture 2 (HC2) HRHPV DNA-test (Tabell 1), med eventuella avvikelser som löstes med Linear Array (LA) HPV-genotypningstest (Roche Molecular Systems, Pleasanton, CA) (8). Enligt Pearsons chi-square-test var det en signifikant skillnad i antalet positiva och negativa prover som identifierades av de två HPV-testerna (P < 0, 001). Överensstämmelsen mellan de två testerna var dock statistiskt stark, med en avtalsnivå på 88,33% (P = 0,0218) och Cohens kappa-koefficient på 0,767 (95% konfidensintervall , 0,674 till 0,860; P < 0,001), där 95% konfidensintervall för kappa-värdena härleddes från en binomialfördelning.

i de diskordanta proverna upptäckte la HPV-testet lågrisk HPV (lrHPV) genotyper i 50% (2/4) av proverna som var HC2-positiva och Cobas negativa och i 13,33% (2/15) av prover som var HC2 negativa och Cobas positiva. HPV53 hittades i två prover som var HC2-positiva och Cobas-negativa, vilket tyder på att sonderna i Digene kit korsreagerade med denna HPV-genotyp. Denna observation är inte förvånande, eftersom KORSREAKTIVITETEN hos HC2-testet med lrhpv-genotyper, specifikt HPV53, observerades tidigare (9). Konsekvensen av lrhpv genotyp korsreaktivitet i ett HPV-test är ett ökat antal falskt positiva resultat. Detta kan leda till överundersökning och överbehandling genom uppföljningstestning av kvinnor som endast har lrhpv-genotyper och faktiskt har låg risk att utveckla livmoderhalscancer. I två HC2-negativa / Cobas-positiva prover detekterades HPV62 och HPV89 (CP6108) i båda proverna och HPV42, HPV54, HPV55, HPV61, HPV70 och HPV84 detekterades i ett av proverna, vilket tyder på att blandad HPV-infektion leder till falskt positiva resultat av Cobas HPV-testet.

la HPV-testet detekterade hrhpv-genotyper i inget av proverna som var HC2-positiva och Cobas-negativa (0/4) och i 80% (12/15) av proverna som var HC2-negativa och Cobas-positiva. HC2-testet kunde inte detektera hrHPV i dessa prover, vilket indikerar att HC2-testet missade mer hrhpv-genotyper än Cobas-testet, vilket antyder att Cobas är en potentiellt effektivare screeninganalys på grund av bättre känslighet och noggrannhet. Däremot detekterades inte HPV genom la HPV-testet i 6,67% (1/15) av de HC2-negativa/Cobas-positiva proverna. Sammantaget var dock skillnaden i detektering av hrHPV mellan HC2-och Cobas-test fortfarande statistiskt obetydlig(2,901 xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx xnumx).

sextioåtta prover användes sedan för att bestämma reproducerbarheten av Cobas HPV-testet. Reproducerbarheten mellan de initiala och upprepade testerna, beräknad med en standard 2-by-2 beredskapstabell, var 93,55%; kappa-koefficienten mellan resultaten från den första och andra omgången av Cobas-testning var 0,869 (95% CI, 0,744 till 0,993; P < 0,001). Styrkan i detta Avtal anses vara mycket bra, vilket tyder på att analysen är mycket tillförlitlig.

ett hundra åttiosju prover testades med Cobas HPV-test för att bestämma skillnaden i HPV-detektion mellan prealiquoted och postaliquoted prover. Endast 7 prover matchades, för en hastighet av 3,74% (95% CI, 1,02% till 6,46%). Statistisk analys avslöjade att skillnaden mellan prealiquoted och postaliquoted prover inte var signifikant (2,233 xnumx, p = 0,36290). Eftersom ingen ökning av HPV-positiv hastighet observerades före och efter cytologiprocessen (prealiquot kontra postaliquot) är korskontaminering av prover under cytologibehandling extremt sällsynt. HPV-testning efter cytologi kan avsevärt förbättra arbetsflödet och minska onödig alikvotering när ett reflex HPV-test för onormal cytologi är avsett.

slutligen testades 5 621 prover med Cobas HPV-test för att bestämma effekterna av virvlande och virvlande (före Cobas-testning) på felfrekvenser. Bland 1 380 prover som behandlades med vortexing var felfrekvensen 4.57% (95% ki, 3, 65% till 5, 91%). Däremot var felfrekvensen bland 4 241 prover som behandlades genom virvlande 1,16% (95% CI, 0,84% till 1,48%). Pearsons chi-square-test avslöjade att skillnaderna i felfrekvenserna mellan virvlade och försiktigt virvlade prover var extremt signifikanta (2 = 59,983, p < 0,0001), med mild virvlande rekommenderas för att minska Cobas felfrekvens.

Sammanfattningsvis visade Cobas 4800 HPV-testet en högre grad av känslighet och specificitet vid detektering av hrhpv-genotyper än Digene HC2 hrHPV-testet. Cobas-testet hade också en lägre nivå av korsreaktivitet med lrHPV-genotyper än HC2-testet, vilket framgår av de färre falskt positiva Fallen. Skillnaden i övergripande prestanda mellan dessa två tester är dock statistiskt inte signifikant.