articles Colletotrichum gloeosporioides artskompleks
grænsen for Colletotrichum gloeosporioides artskompleks er defineret genetisk, baseret på en stærkt understøttet clade inden for Colletotrichum dets gentræ. Alle takser, der accepteres inden for denne klade, er morfologisk mere eller mindre typiske for de bredt definerede C. gloeosporioides, som det er blevet anvendt i litteraturen i fortiden 50 flere år. Vi accepterer 22 arter plus en underart inden for C. gloeosporioides-komplekset. Disse omfatter C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale, og C. C. Musae, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. Aotearoa, C. clidemiae, C. kahaae subsp. ciggaro, C. salsolaeog C. ti plus nom. nov. C. gloeosporioides var (for C. gloeosporioides var. minus). Alle taksa defineres genetisk på basis af multi-gen fylogenier. Der gives korte morfologiske beskrivelser for arter, hvor der ikke findes nogen moderne beskrivelse. Mange af arterne kan ikke skelnes pålideligt ved hjælp af dets, det officielle stregkodningsgen for svampe. Særligt problematisk er et sæt arter genetisk tæt på C. musae og et andet sæt arter genetisk tæt på C. kahaae, her omtalt som Musae clade og Kahaae clade, henholdsvis. Hver klade indeholder flere arter, der er fylogenetisk godt understøttet i multi-genanalyser, men inden for kladerne er grenlængder korte på grund af det lille antal fylogenetisk informative tegn, og i nogle få tilfælde er individuelle gentræer inkongruente. Nogle enkelte gener eller kombinationer af gener, såsom glyceraldehyd-3-phosphatdehydrogenase og glutaminsyntetase, kan bruges til pålideligt at skelne de fleste takser og skal udvikles som sekundære stregkoder til identifikation af artsniveau, hvilket er vigtigt, fordi mange af disse svampe er af biosikkerhedsmæssig betydning. Ud over de accepterede arter, der findes noter til navne, hvor et muligt tæt forhold til C. gloeosporioides sensu lato er blevet foreslået i den nylige litteratur, sammen med alle subspecifikke takser og formae-specialer inden for C. gloeosporioides og dens formodede Teleomorph Glomerella Cingulata.
taksonomiske nyheder:udskiftning af navn – C. dronninglandicum B. overløb & P. R. Johnst. Nye arter-C. aenigma B. overløb & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. V. & P. R. Johnst., C. alatae B. V. & P. R. Johnst., C. alienum B. V. & P. R. Johnst, C. aotearoa B. V. & P. R. Johnst., C. clidemiae B. over & P. R. Johnst., C. salsolae B. V. & P. R. Johnst., C. ti B. over & P. R. Johnst. Nye underarter-C. kahaae subsp. ciggaro B. V. & P. R. Johnst. Typificering: Epitypification-P. R. Johnst.
