articles complexul de specii Colletotrichum gloeosporioides
limita complexului de specii Colletotrichum gloeosporioides este definită genetic, pe baza unei clade puternic susținute în arborele genic Colletotrichum ITS. Toți taxonii acceptați în cadrul acestei clade sunt morfologic mai mult sau mai puțin tipici C. gloeosporioides definiți pe larg, așa cum a fost aplicat în literatura de specialitate în ultimii 50 de ani. Acceptăm 22 de specii plus o subspecie în cadrul complexului C. gloeosporioides. Acestea includ C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale și C. xanthorrhoeae, împreună cu taxonii descriși aici ca noi, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae, și C. ti, plus nom. nov. C. queenslandicum (pentru C. gloeosporioides var. minus). Toți taxonii sunt definiți genetic pe baza filogeniilor multi-genice. Scurte descrieri morfologice sunt furnizate pentru speciile în care nu este disponibilă o descriere modernă. Multe dintre specii nu pot fi distinse în mod fiabil folosind sale, gena oficială de codare de bare pentru ciuperci. Deosebit de problematice sunt un set de specii apropiate genetic de C. musae și un alt set de specii apropiate genetic de C. kahawae, denumit aici Clada Musae și respectiv clada Kahawae. Fiecare cladă conține mai multe specii care sunt bine susținute filogenetic în analizele multi-genice, dar în cadrul cladelor lungimile ramurilor sunt scurte din cauza numărului mic de caractere informative filogenetice și, în câteva cazuri, arborii genici individuali sunt incongruenți. Unele gene unice sau combinații de gene, cum ar fi gliceraldehidă-3-fosfat dehidrogenază și glutamină sintetază, pot fi utilizate pentru a distinge în mod fiabil Majoritatea taxonilor și vor trebui dezvoltate ca coduri de bare secundare pentru identificarea la nivel de specie, ceea ce este important deoarece multe dintre aceste ciuperci au o semnificație de biosecuritate. În plus față de speciile acceptate, sunt furnizate note pentru nume în care o posibilă relație strânsă cu C. gloeosporioides sensu lato a fost sugerat în literatura recentă, împreună cu toți taxonii subspecifici și formele speciale din cadrul C. gloeosporioides și presupusul său Teleomorf Glomerella cingulata.
Noutăți taxonomice:înlocuirea numelui – C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. Specii noi – C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. eschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Subspecii noi-C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Tipificare: Epitypification – C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
