articula o complexo de espécies de Colletotrichum gloeosporioides

o limite do complexo de espécies de Colletotrichum gloeosporioides é definido geneticamente, com base num clado fortemente apoiado no Colletotrichum a sua árvore genética. Todos os taxa aceitos dentro deste clado são morfologicamente mais ou menos típicos dos C. gloeosporioides amplamente definidos, como tem sido aplicado na literatura nos últimos 50 anos. Aceitamos 22 espécies mais uma subespécie no complexo de C. gloeosporioides. Estes incluem C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale, e C. xanthorrhoeae, juntamente com os táxons descritos aqui como nova, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae, e C. ti, mais o nom. novembro. C. queenslandicum (para C. gloeosporioides var. menos). Todos os taxa são definidos geneticamente com base em filogenias multi-gene. São fornecidas breves descrições morfológicas para as espécies em que não existe uma descrição moderna. Muitas das espécies são incapazes de ser distinguidas de forma confiável usando o seu, o gene oficial de codificação de barras para fungos. Particularmente problemático são um conjunto de espécies geneticamente perto de C. musae e outro conjunto de espécies geneticamente perto de C. kahawae, referido aqui como o Musae clado e o Kahawae clado, respectivamente. Cada clado contém várias espécies que são filogeneticamente bem suportadas em análises multi-gene, mas dentro dos comprimentos dos ramos clades são curtos por causa do pequeno número de caracteres filogeneticamente informativos, e em alguns casos as árvores de genes individuais são incongruentes. Alguns genes únicos ou combinações de genes, tais como gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase e glutamina sintetase, podem ser usados para distinguir fiavelmente a maioria dos taxa e terá de ser desenvolvido como códigos de barras secundários para identificação de nível de espécie, o que é importante porque muitos destes fungos são de significado de biossegurança. Além das espécies aceitas, são fornecidas notas para nomes onde uma possível relação próxima com C. gloeosporioides sensu lato foi sugerida na literatura recente, juntamente com todos os taxa subespecíficos e formae speciales dentro C. gloeosporioides e a sua putativa teleomorph Glomerella cingulata.

novidades taxonómicas: substituição de nomes-C. Queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. New species-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nova subespécie – C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Tipificacao: Epitypification – C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.

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