コイルコイル

“ファミリーとドメイン”セクションのこのサブセクションは、タンパク質内のコイルコイルの領域の位置を示します。

コイル状のコイルは、2つ以上のαヘリックスによって構築され、互いに巻き付けられてスーパーコイルを形成します。 バンドルには2つ、3つ、または4つのヘリックスがあり、それらは同じ（平行）方向または反対の（反平行）方向のいずれかで実行される可能性があります。

本質的にコイル状のコイルは、疎水性パターンおよび残基組成が両親媒性αヘリックスの構造と適合する三残基および四残基の配列要素から構 アミノ酸がａ’、ｂ’、ｃ’、ｄ’、ｅ’、ｆ’およびｇ’と示されるヘプタッド繰り返しを構成する。 位置「ａ」および「ｄ」の残基は、一般に疎水性であり、別の鎖上で同様のパターンと連動して密着した疎水性コアを形成するノブおよび穴のジグザグパターンを 残りの残基のうち、「ｂ」、「ｃ」、および「ｆ」は荷電する傾向がある。 したがって、ヘプタドリピートの形成は、特定のアミノ酸ではなく、特定の位置で必要とされる疎水性および電荷の物理的性質に依存する。

コイル領域を有するタンパク質の例としては、ミオシン、トロポミオシン、中間フィラメントが挙げられる。

UniProtKB/Swiss-Protでは、LupasのCOILSプログラムを使用して予測されたコイルコイルに注釈を付けます。 予測されるコイルコイルの最小サイズは28アミノ酸である。 二つのコイルコイルが25アミノ酸未満の距離で分離されている場合、それらは単一のコイルコイルを形成するためにマージされます。 コイル状のコイルは、通常、正確な境界がほとんどの場合決定されていないため、実験的に証明されている場合でも、”シーケンス解析”の証拠で注釈が付
例：O15697、Q9Y2D8、O97593

コイルコイルおよびロイシンジッパー

ロイシンジッパーは、ヘプタッド繰り返しの”d”位置でアミノ酸ロイシンが優勢であるコイルコイルのサブタイプを構成する。 それらは28のアミノ酸より短いかもしれません。 ロイシンジッパーの存在を報告する論文では，提案されたロイシンジッパーが蛋白質の機能にとって重要であることが証明されていない限り，通常これをコイルコイルとして注釈する。 その場合、我々は’ドメインと繰り返し’サブセクションでロイシンジッパーに注釈を付けます。
例:P18289,P15407

UniProtKB/TrEMBLでは、コイルを使用してシーケンス注釈モジュールによってコイル領域に自動的に注釈が付けられます。

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