ArticlesThe Colletotrichum gloeosporioides種複合体

Colletotrichum gloeosporioides種複合体の限界は、Colletotrichumの遺伝子ツリー内の強く支持されたクレードに基づいて遺伝的に定義されています。 このクレード内で受け入れられたすべての分類群は、過去50年間の文献に適用されているように、形態学的に広く定義されたC.gloeosporioidesの多かれ少なかれ典型的 私たちは、C.gloeosporioides複合体内の22種プラス一つの亜種を受け入れます。 これらにはCが含まれます。 asianum,C.cordylinicola,C.fructicola,C.gloeosporioides,c.horii,C.kahawae subsp. ｃ．ｍｕｓａｅ，Ｃ．ｎｕｐｈａｒｉｃｏｌａ，Ｃ．ｐｓｉｄｉｉ，Ｃ．ｓｉａｍｅｎｓｅ，Ｃ．ｔｈｅｏｂｒｏｍｉｃｏｌａ，ｃ．ｔｒｏｐｉｃａｌｅ，およびＣ．ｘａｎｔｈｏｒｒｈｏｅａｅは，ここでｎｅｗ，ｃ．ａｅｎｉｇｍａ，Ｃ．ａｅｓｃｈｙｎｏｍｅｎｅｓ，Ｃ．ａｌａｔａｅ，Ｃ．ａｅｌｉｎｕｍ，Ｃ．ａｏｔｅａｒｏａ，Ｃ．ｃｌｉｄｅｍｉａｅ，Ｃ．ｋａｈａｗａｅｓｕｂｓｐとして記載されている分類群とともに，ｃ．ｓｉａｍｅｎｓｅ，Ｃ．ｔｈｅｏｂｒｏｍｉｃｏｌａ，Ｃ．ｔｒｏｐｉｃａｌｅ，およびｃ．ｘａｎｔｈｏｒｒｈｏｅａｅに記載されている。 ciggaro、C.salsolae、およびC.ti、およびnom。 【送料無料】【 C.queenslandicum(c.gloeosporioides var. マイナス）。 すべての分類群は、多遺伝子系統に基づいて遺伝的に定義されている。 現代的な記述がない種については、簡単な形態学的記述が提供されている。 種の多くは、真菌の公式のバーコード遺伝子であるITSを使用して確実に区別することができません。 特に問題となるのは、c.musaeに遺伝的に近い種のセットと、c.kahawaeに遺伝的に近い種の別のセットであり、ここではそれぞれMusaeクレードとKahawaeクレードと呼ばれる。 各クレードには複数の遺伝子解析で系統的によくサポートされているいくつかの種が含まれていますが、クレード内の分岐長は系統的に有益な文字の数が少ないため短く、いくつかのケースでは個々の遺伝子ツリーが一致していません。 グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼやグルタミン合成酵素のような単一の遺伝子や遺伝子の組み合わせは、ほとんどの分類群を確実に区別するために使用することができ、種レベルの同定のための二次バーコードとして開発する必要があり、これらの真菌の多くは生物安全性の重要性を持っているため重要である。 受け入れられた種に加えて、最近の文献でC.gloeosporioides sensu latoとの可能性のある密接な関係が示唆されている名前、およびC内のすべての亜種分類群およびformae specialesについ gloeosporioidesとその推定teleomorph Glomerella cingulata。

分類学的ノベルティ：名前の置換-C.queenslandicum B.Weir&P.R.Johnst. 新種-C.aenigma B.Weir&P.R.Johnst.,C.aeschynomenes B.Weir&P.R.Johnst.,C.alatae B.Weir&P.R.Johnst.,C.alienum B.Weir&P.R.Johnst,C.aotearoa B.Weir&P.R.Johnst.,C.clidemiae B.Weir&P.R.Johnst.,C.salsolae B.Weir&P.R.Johnst.,C.ti B.Weir&P.R.Johnst. 新しい亜種-C.kahawae subsp. & タイプ化: C.queenslandicum B.Weir&P.R.Johnst.