코일 코일

‘가족 및 도메인’섹션의이 하위 섹션 단백질 내에서 코일 코일의 영역의 위치를 나타냅니다.

코일 코일은 두 개 이상의 알파 나선에 의해 서로 감아 수퍼 코일을 형성합니다. 번들에는 2 개,3 개 또는 4 개의 나선이있을 수 있으며 동일한(병렬)또는 반대 방향(반 평행)방향으로 실행할 수 있습니다.

본질적으로 코일 코일은 소수성 패턴 및 잔기 조성이 양친 매성 알파-나선의 구조와 호환되는 3 개 및 4 개의 잔기의 서열 요소로 구성됩니다. 3 개 및 4 개의 잔기 서열 요소가 교대로 구성 헵타드 반복 여기서 아미노산은’,’비’,’씨’,’디’,’이자형’,’에프’및’지’. 위치’에이’및’디’의 잔기는 일반적으로 소수성이고 꽉 끼는 소수성 코어를 형성하기 위해 다른 가닥에 유사한 패턴과 연동 노브 및 구멍의 지그재그 패턴을 형성한다. 이 경우,상기 잔류물 중’비’,’기음’및’에프’가 충전되는 경향이 있다. 따라서 헵타드 반복의 형성은 특정 아미노산이 아닌 특정 위치에서 요구되는 소수성 및 전하의 물리적 특성에 의존한다.

코일 코일 영역을 갖는 단백질의 예는 미오신,트로포미오신 및 중간 필라멘트를 포함한다.우리는 루파스의 코일 프로그램을 사용하여 예측된 코일 코일에 주석을 달았다. 예상 코일 코일의 최소 크기는 28 아미노산입니다. 2 개의 코일 코일이 거리에 의해 25 이하 아미노산 분리되는 곳에 단 하나 코일 코일을 형성하기 위하여 합병됩니다. 코일 코일은 일반적으로 그들의 정확한 테두리는 대부분의 경우에 결정 되지 않은 이후 실험적으로 입증 하는 경우에’시퀀스 분석’증거와 주석.코일된 코일 및 류신-지퍼

류신-지퍼는 아미노산 류신이 헵타드 반복의’디’위치에서 우세한 코일 코일의 하위 유형을 구성한다. 그들은 28 아미노산보다 짧을 수 있습니다. 종이가 류신 지퍼의 실존을 보고할 때,제안한 류신 지퍼가 단백질의 기능을 위해 중요한 입증되면 않는 한 우리는 코일 코일로 보통 이것을 주석을 답니다. 이 경우’도메인 및 반복’하위 섹션에서 류신 지퍼에 주석을 달 수 있습니다.코일된 코일 영역은 코일을 사용하여 시퀀스 주석 모듈에 의해 자동으로 주석 처리됩니다.

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