Articlethe Colletotrichum gloeosporioides species complex
grensen For colletotrichum gloeosporioides species complex er definert genetisk, basert på en sterkt støttet klade innenfor Colletotrichum sitt gent tre. Alle taxa akseptert innenfor denne klade er morfologisk mer eller mindre typisk For de bredt definerte c. gloeosporioides, som det har blitt brukt i litteraturen for det siste 50 år. Vi aksepterer 22 arter pluss en underart innenfor c. gloeosporioides-komplekset. Disse inkluderer C. den er en av de mest kjente artene i verden. i tillegg til å være en del av det som er beskrevet her, er det også en del av det som er beskrevet her som ny: c. aenigma, c. aeschynomenes, c. alatae, c. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, c. kahawae, c. kahawae, c. aotearoa, C. clidemiae, c. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae, og c. ti, pluss nom. nov. C. queenslandicum (for c. gloeosporioides var. minus). Alle taxa er definert genetisk på grunnlag av multi-gen fylogenier. Korte morfologiske beskrivelser er gitt for arter der ingen moderne beskrivelse er tilgjengelig. Mange av artene er ikke i stand til å bli pålitelig skilt ved HJELP AV ITS, det offisielle strekkodingsgenet for sopp. Spesielt problematisk er et sett av arter genetisk nær C. musae og et annet sett av arter genetisk nær C. kahawae, referert til her Som Musae clade og Kahawae clade, henholdsvis. Hver klade inneholder flere arter som er fylogenetisk godt støttet i multi-gen analyser, men innenfor clades gren lengder er korte på grunn av det lille antallet fylogenetisk informative tegn, og i noen tilfeller enkelte gentrær er urimelig. Noen enkeltgener eller kombinasjoner av gener, som glyceraldehyd-3-fosfat dehydrogenase og glutaminsyntetase, kan brukes til å skille de fleste taxa på en pålitelig måte og må utvikles som sekundære strekkoder for artsnivåidentifikasjon, noe som er viktig fordi mange av disse soppene er av biosikkerhetsmessig betydning. I tillegg til de aksepterte arter, notater er gitt for navn der en mulig nært forhold Til C. gloeosporioides sensu lato har blitt foreslått i nyere litteratur, sammen med alle subspesifikke taxa og formae speciales innen C. gloeosporioides og dens antatte Teleomorf Glomerella cingulata.
Taksonomiske nyheter: Navn erstatning-c. queenslandicum B. Weir & Pr Johnst. Nye arter-C. aenigma B. Weir & Pr Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & Pr Johnst, C. aotearoa B. Weir & Pr Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nye underarter-C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & Pr Johnst. Typifisering: Epitypification-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
