Articlehet Colletotrichum gloeosporioides species complex
de limiet van het Colletotrichum gloeosporioides species complex is genetisch gedefinieerd, op basis van een sterk ondersteunde clade binnen de Colletotrichum zijn genboom. Alle binnen deze clade aanvaarde taxa zijn morfologisch min of meer typerend voor de breed gedefinieerde C. gloeosporioides, zoals het de afgelopen 50 jaar in de literatuur wordt toegepast. We accepteren 22 soorten plus één ondersoort binnen het C. gloeosporioides complex. Deze omvatten C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale, en C. xanthorrhoeae, samen met de hier beschreven taxa als nieuw, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae, en C. ti, plus de nom. nov. C. queenslandicum (voor C. gloeosporioides var. min). Alle taxa zijn genetisch bepaald op basis van multi-gen fylogenieën. Er worden korte morfologische beschrijvingen gegeven voor soorten waarvoor geen moderne beschrijving beschikbaar is. Veel van de soorten zijn niet betrouwbaar te onderscheiden met behulp van ITS, het officiële barcoding gen voor schimmels. Bijzonder problematisch zijn een verzameling van soorten die genetisch dicht bij C. musae en een andere verzameling van soorten die genetisch dicht bij C. kahawae, hier aangeduid als de Musae clade en de Kahawae clade, respectievelijk. Elke clade bevat verscheidene species die fylogenetically goed in multi-genanalyses worden gesteund, maar binnen de clades zijn de aftaklengtes kort wegens het kleine aantal fylogenetically informatieve karakters, en in een paar gevallen zijn individuele genbomen incongruent. Sommige enkele genen of combinaties van genen, zoals glyceraldehyde-3-fosfaat dehydrogenase en glutaminesynthetase, kunnen worden gebruikt om de meeste taxa betrouwbaar te onderscheiden en zullen moeten worden ontwikkeld als secundaire barcodes voor identificatie op soortniveau, wat belangrijk is omdat veel van deze schimmels van bioveiligheid belang zijn. Naast de geaccepteerde soorten worden ook namen vermeld waar een mogelijke nauwe relatie met C. gloeosporioides sensu lato is gesuggereerd in de recente literatuur, samen met alle subspecifieke taxa en formae speciales binnen C. gloeosporioides en zijn vermeende teleomorf Glomerella cingulata.Taxonomische nieuwigheden: Naamvervanging – C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. New species-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nieuwe ondersoort-C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Typering: Epitypification-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
