artículosEl complejo de especies de Colletotrichum gloeosporioides
El límite del complejo de especies de Colletotrichum gloeosporioides se define genéticamente, basado en un clado fuertemente apoyado dentro del árbol genético de Colletotrichum. Todos los taxones aceptados dentro de este clado son morfológicamente más o menos típicos de la ampliamente definida C. gloeosporioides, tal como se ha aplicado en la literatura durante los últimos 50 años. Aceptamos 22 especies más una subespecie dentro del complejo C. gloeosporioides. Estos incluyen C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale, y C. xanthorrhoeae, junto con los taxones descritos como nuevos, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae, y C. ti, más la nom. nov. C. queenslandicum (para C. gloeosporioides var. menos). Todos los taxones se definen genéticamente sobre la base de filogenias de múltiples genes. Se proporcionan descripciones morfológicas breves para las especies en las que no se dispone de una descripción moderna. Muchas de las especies no pueden distinguirse de manera confiable usando ITS, el gen oficial de código de barras para hongos. Particularmente problemáticos son un conjunto de especies genéticamente cercanas a C. musae y otro conjunto de especies genéticamente cercanas a C. kahawae, referidas aquí como el clado Musae y el clado Kahawae, respectivamente. Cada clado contiene varias especies que están bien apoyadas filogenéticamente en análisis de múltiples genes, pero dentro de los clados las longitudes de las ramas son cortas debido al pequeño número de caracteres filogenéticamente informativos, y en unos pocos casos los árboles genéticos individuales son incongruentes. Algunos genes individuales o combinaciones de genes, como la gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa y la glutamina sintetasa, se pueden usar para distinguir de manera confiable la mayoría de los taxones y deberán desarrollarse como códigos de barras secundarios para la identificación a nivel de especie, lo cual es importante porque muchos de estos hongos tienen importancia de bioseguridad. Además de las especies aceptadas, se proporcionan notas para los nombres donde se ha sugerido una posible relación cercana con C. gloeosporioides sensu lato en la literatura reciente, junto con todos los taxones subespecíficos y formae speciales dentro de C. gloeosporioides y su supuesta teleomorfa Glomerella cingulata.
Novedades taxonómicas: Sustitución de nombres-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. Nueva especie-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nueva subespecie-C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Tipificación: Epitypification-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
