article The Colletotrichum gloeosporioides species complex
colletotrichum gloeosporioides species complex on määritelty geneettisesti, perustuen colletotrichum gloeosporioides-lajikompleksiin, joka on voimakkaasti tuettu kladi sen geenipuussa. Kaikki tämän kladin sisällä hyväksytyt taksonit ovat morfologisesti enemmän tai vähemmän tyypillisiä laajasti määritellylle C. gloeosporioides-lajille, kuten sitä on sovellettu kirjallisuudessa viimeiset 50 vuotta. Hyväksymme 22 lajia sekä yhden alalajin C. gloeosporioides-kompleksissa. Näihin lukeutuu muun muassa C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale ja C. xanthorrhoeae sekä tässä uutena kuvattu taksoni, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae ja C. ti sekä nimimerkki. Marraskuuta. C. queenslandicum (C. gloeosporioides var. miinus). Kaikki taksonit määritellään geneettisesti monigeenisten fylogeenien perusteella. Lyhyitä morfologisia kuvauksia on lajeista, joiden nykykuvausta ei ole saatavilla. Monia lajeja ei pystytä luotettavasti erottamaan sen, sienten virallisen viivakoodigeenin, avulla. Erityisen ongelmallisia ovat geneettisesti C. musaeta lähellä olevat lajit ja toinen C. kahawaeta geneettisesti lähellä olevat lajit, joista tässä käytetään nimityksiä Musae clade ja Kahawae clade. Jokainen kladi sisältää useita lajeja, jotka ovat fylogeneettisesti hyvin tuettuja monigeenianalyyseissä, mutta kladien haarapituudet ovat lyhyitä fylogeneettisesti informatiivisten merkkien pienen määrän vuoksi, ja muutamissa tapauksissa yksittäiset geenipuut ovat epäjohdonmukaisia. Joitakin yksittäisiä geenejä tai geeniyhdistelmiä, kuten glyseraldehydi-3-fosfaattidehydrogenaasia ja glutamiinisyntetaasia, voidaan käyttää luotettavasti erottamaan useimmat taksonit, ja ne on kehitettävä toissijaisiksi viivakoodeiksi lajitason tunnistamiseksi, mikä on tärkeää, koska monet näistä sienistä ovat bioturvallisuudeltaan merkittäviä. Hyväksyttyjen lajien lisäksi muistiinpanoista löytyvät nimet, joiden mahdollista läheistä suhdetta C. gloeosporioides sensu latoon on tuoreessa kirjallisuudessa ehdotettu, sekä kaikki C: n alispesifiset taksonit ja formae speciales. gloeosporioides ja sen oletettu teleomorph Glomerella Cingulata.
taksonomiset uutuudet:nimien korvaaja-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. Uudet lajit-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Uusi alalaji – C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Typistäminen: Epitypification-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
