Classification proposée des cellules dans le Modèle fondamental d'anatomie | Jiotower

Bien que Schleidig et Schwan aient proposé la théorie des cellules il y a plus de 150 ans, une classification satisfaisante et complète des cellules reste à établir. Les schémas de classification variés et incohérents impliqués par les sources papier traditionnelles et contemporaines en biologie et en médecine conviennent à l’utilisation humaine, mais ne répondent pas aux exigences pour soutenir l’inférence basée sur la machine.

Bien que de nombreuses informations restent à instancier, l’extension de la composante de taxonomie anatomique (At) du Modèle fondamental d’anatomie (FMA) aux niveaux microscopiques et macromoléculaires établit l’espace d’information permettant de tenir compte des divers attributs de la grande variété de types de cellules qui constituent le corps humain. Le système d’acquisition de connaissances Protégé-2000 basé sur une trame, dans lequel la FMA est mise en œuvre, permet une navigation transparente des organes et des systèmes organiques aux tissus, aux cellules et à leurs composants microscopiques et macromoléculaires. Conformément au contexte structurel de la FMA, nous nous sommes appuyés sur des attributs structurels héritables pour classer les cellules et leurs parties.

La cellule de classe hérite des attributs déterminants de sa structure anatomique de superclasse (entité anatomique physique matérielle qui a une forme 3D inhérente; est générée par l’expression coordonnée des propres gènes structurels de l’organisme) et se distingue de ses classes sœurs par son propre ensemble d’attributs déterminants (Structure anatomique constituée d’un cytoplasme entouré d’une membrane plasmique, avec ou sans le noyau cellulaire). Ces attributs de définition sont représentés sous forme d’emplacements dans un cadre de concept. En plus des attributs structurels illustrés à la figure 1, le cadre d’une cellule peut également accueillir des attributs spécifiques à la cellule, tels que l’état prolifératif par rapport à l’état non prolifératif, la lignée cellulaire somatique par rapport à la lignée germinale et le type de tissu. De nombreuses parties cellulaires et structures macromoléculaires biologiques ont été instanciées et leurs attributs et valeurs hérités ont été inclus.