Föreslagen klassificering av celler i den grundläggande modellen för anatomi | Jiotower

även om Schleidig och Schwan föreslog cellteorin för över 150 år sedan, återstår en tillfredsställande och omfattande klassificering av celler att fastställas. De varierade och inkonsekventa klassificeringsscheman som antyds av traditionella och samtida papperskopiakällor inom biologi och medicin är tillräckliga för mänsklig användning, men saknar kraven för att stödja maskinbaserad inferens.

även om mycket information återstår att instansieras, utvidgningen av Anatomy taxonomy (At) – komponenten i den grundläggande modellen för anatomi (FMA) till mikroskopiska och makromolekylära nivåer etablerar informationsutrymmet för att tillgodose de olika attributen för den stora variationen av celltyper som utgör människokroppen. Det rambaserade Prot-systemet för kunskapsförvärv, där FMA implementeras, stöder sömlös navigering från organ och organsystem till vävnader, celler och deras mikroskopiska och makromolekylära komponenter. I överensstämmelse med FMA: s strukturella sammanhang förlitade vi oss på ärftliga strukturella attribut för att klassificera celler och deras delar.

klasscellen ärver de definierande attributen för sin superklass anatomiska struktur ( materiell fysisk anatomisk enhet som har inneboende 3D-form; genereras av samordnat uttryck av organismens egna strukturgener) och skiljer sig från sina syskonklasser genom sin egen uppsättning definierande attribut (anatomisk struktur som består av cytoplasma omgiven av ett plasmamembran, med eller utan cellkärnan). Dessa definierande attribut representeras som slitsar i en konceptram. Förutom strukturella attribut som visas i Figur 1 kan ramen för en cell också rymma cellspecifika attribut, såsom proliferativ vs. icke-proliferativ tillstånd, somatisk vs. könscellslinje och vävnadstyp. Många celldelar och biologiska makromolekylära strukturer har instansierats och deras ärvda attribut och värden har inkluderats.