articoliil Colletotrichum gloeosporioides species complex
Il limite del Colletotrichum gloeosporioides species complex è definito geneticamente, sulla base di un clade fortemente supportato all’interno del Colletotrichum IL SUO albero genetico. Tutti i taxa accettati all’interno di questo clade sono morfologicamente più o meno tipici del C. gloeosporioides ampiamente definito, come è stato applicato in letteratura negli ultimi 50 anni. Si accettano 22 specie più una sottospecie all’interno del complesso C. gloeosporioides. Questi includono C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. il taxa è una pianta erbacea perenne appartenente alla famiglia dei taxa, appartenente alla famiglia dei taxa. ciggaro, C. salsolae, e C. ti, più il nom. ov. C. queenslandicum (per C. gloeosporioides var. meno). Tutti i taxa sono definiti geneticamente sulla base di filogenie multi-geniche. Brevi descrizioni morfologiche sono fornite per le specie in cui non è disponibile una descrizione moderna. Molte delle specie non sono in grado di essere distinte in modo affidabile utilizzando ITS, il gene ufficiale di barcoding per i funghi. Particolarmente problematici sono un insieme di specie geneticamente vicino a C. musae e un altro insieme di specie geneticamente vicino a C. kahawae, indicato qui come il clade Musae e il clade Kahawae, rispettivamente. Ogni clade contiene diverse specie che sono filogeneticamente ben supportato in analisi multi-gene, ma all ” interno del ramo cladi lunghezze sono brevi a causa del piccolo numero di caratteri filogeneticamente informativi, e in alcuni casi singoli alberi genici sono incongruenti. Alcuni singoli geni o combinazioni di geni, come la gliceraldeide-3-fosfato deidrogenasi e la glutammina sintetasi, possono essere utilizzati per distinguere in modo affidabile la maggior parte dei taxa e dovranno essere sviluppati come codici a barre secondari per l’identificazione a livello di specie, che è importante perché molti di questi funghi hanno un significato di biosicurezza. Oltre alle specie accettate, sono fornite note per i nomi in cui una possibile stretta relazione con C. gloeosporioides sensu lato è stata suggerita nella letteratura recente, insieme a tutti i taxa e formae speciales subspecifici all’interno di C. gloeosporioides e il suo presunto teleomorfo Glomerella cingulata.
Novità tassonomiche: Sostituzione del nome – C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. Nuova specie-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nuova sottospecie – C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Tipizzazione: Il suo nome deriva dal latino””.
