Classificazione proposta delle cellule nel modello fondamentale di anatomia | Jiotower
Sebbene Schleidig e Schwan abbiano proposto la teoria cellulare oltre 150 anni fa, rimane da stabilire una classificazione soddisfacente e completa delle cellule. Gli schemi di classificazione vari e incoerenti implicati dalle fonti cartacee tradizionali e contemporanee in biologia e medicina sono adeguati per l’uso umano, ma non soddisfano i requisiti per supportare l’inferenza basata sulla macchina.
Sebbene molte informazioni rimangano da istanziare, l’estensione della componente anatomica tassonomia (At) del Modello fondamentale di Anatomia (FMA) a livelli microscopici e macromolecolari stabilisce lo spazio informativo per accogliere i diversi attributi della grande varietà di tipi di cellule che costituiscono il corpo umano. Il sistema di acquisizione della conoscenza Protégé-2000 basato su frame, in cui è implementata la FMA, supporta la navigazione senza interruzioni da organi e sistemi di organi ai tessuti, alle cellule e ai loro componenti microscopici e macromolecolari. Coerentemente con il contesto strutturale della FMA, abbiamo fatto affidamento su attributi strutturali ereditabili per classificare le celle e le loro parti.
La Cellula di classe eredita gli attributi definitivi della sua struttura anatomica superclasse (entità anatomica fisica materiale che ha una forma intrinseca 3D; è generata dall’espressione coordinata dei geni strutturali dell’organismo) e si distingue dalle sue classi fratelli dal proprio insieme di attributi definitivi ( struttura anatomica costituita da citoplasma circondato da una membrana plasmatica, con o senza il nucleo cellulare). Questi attributi di definizione sono rappresentati come slot in un quadro concettuale. Oltre agli attributi strutturali mostrati in Figura 1, il frame di una cellula può anche ospitare attributi specifici della cellula, come lo stato proliferativo rispetto a quello non proliferativo, il lignaggio somatico rispetto a quello delle cellule germinali e il tipo di tessuto. Molte parti cellulari e strutture macromolecolari biologiche sono state istanziate e sono stati inclusi i loro attributi e valori ereditati.
Una sezione di tassonomia anatomica con gli attributi della cella di classe, visualizzata attraverso il Foundational Model Explorer (FME),3 un browser Web che fornisce una visione semplificata dei fotogrammi protetti.
