Ehdotettu solujen luokittelu anatomian perusmallissa | Jiotower
vaikka Schleidig ja Schwan ehdottivat soluteoriaa yli 150 vuotta sitten, tyydyttävä ja kattava soluluokitus on vielä vahvistamatta. Kirjavat ja epäjohdonmukaiset luokittelujärjestelmät, joita biologian ja lääketieteen perinteisillä ja nykyaikaisilla paperilähteillä tarkoitetaan, ovat riittäviä ihmisten käyttöön, mutta eivät täytä vaatimuksia koneellisen päättelyn tukemiseksi.
vaikka paljon tietoa on vielä instantioitavana, anatomian perustavan mallin (FMA) anatomian taksonomian (At) osa-alueen laajentaminen mikroskooppisiin ja makromolekyylisiin tasoihin luo informaatioavaruuden ihmisruumiin muodostavien monien solutyyppien moninaisille ominaisuuksille. Kehyspohjainen Protégé – 2000-tiedonhankintajärjestelmä, jossa FMA toteutetaan, tukee saumatonta navigointia elimistä ja elinjärjestelmistä kudoksiin, soluihin ja niiden mikroskooppisiin ja makromolekyylisiin komponentteihin. FMA: n rakenteellisen kontekstin mukaisesti luotimme periytyviin rakenteellisiin ominaisuuksiin solujen ja niiden osien luokittelussa.
luokkasolu perii sen superluokan anatomisen rakenteen määrittelevät ominaisuudet (aineellinen fysikaalinen anatominen kokonaisuus, jolla on luontainen 3d-muoto; joka syntyy eliön omien rakennegeenien koordinoidusta ilmentymisestä), ja se eroaa sisarusluokistaan omilla määrittelyominaisuuksillaan ( anatominen rakenne, joka koostuu solukalvon ympäröimästä sytoplasmasta, joko soluytimen kanssa tai ilman sitä). Nämä määrittelevät attribuutit esitetään lähtö-ja saapumisaikoina konseptikehyksessä. Kuvassa 1 esitettyjen rakenteellisten ominaisuuksien lisäksi solun runkoon voidaan sijoittaa myös solukohtaisia ominaisuuksia, kuten proliferatiivinen vs. ei-proliferatiivinen tila, somaattinen vs. sukusolulinja ja kudostyyppi. Monet solun osat ja biologiset makromolekyylirakenteet on instantioitu ja niiden perityt ominaisuudet ja arvot on otettu mukaan.
anatomisen taksonomian osa, jossa on Luokkasolun attribuutteja,näytetään Foundational Model Explorerin (FME) kautta, 3 verkkoselain, joka tarjoaa yksinkertaistetun näkymän Protégé-kehyksiin.