ArticlesThe Colletotrichum gloeosporioides species complex
gränsen för Colletotrichum gloeosporioides species complex definieras genetiskt, baserat på en starkt stödd klad i Colletotrichum dess genträd. Alla taxa som accepteras inom denna klad är morfologiskt mer eller mindre typiska för den brett definierade C. gloeosporioides, som den har tillämpats i litteraturen under de senaste 50 åren. Vi accepterar 22 arter plus en underart inom C. gloeosporioides-komplexet. Dessa inkluderar C. asianum, C. cordylinicola, C. fructicola, C. gloeosporioides, C. horii, C. kahawae subsp. kahawae, C. musae, C. nupharicola, C. psidii, C. siamense, C. theobromicola, C. tropicale och C. xanthorrhoeae, tillsammans med taxa som beskrivs här som ny, C. aenigma, C. aeschynomenes, C. alatae, C. alienum, C. aotearoa, C. clidemiae, C. kahawae subsp. ciggaro, C. salsolae och C. ti, plus nom. nov. C. queenslandicum (för C. gloeosporioides var. minus). Alla taxa definieras genetiskt på grundval av multi-gen fylogenier. Korta morfologiska beskrivningar tillhandahålls för arter där ingen modern beskrivning finns tillgänglig. Många av arterna kan inte särskiljas på ett tillförlitligt sätt med hjälp av dess, den officiella streckkodningsgenen för svampar. Särskilt problematiska är en uppsättning arter som är genetiskt nära C. musae och en annan uppsättning arter som är genetiskt nära C. kahawae, som här kallas Musae clade respektive Kahawae clade. Varje klad innehåller flera arter som är fylogenetiskt väl stödda i multigenanalyser, men inom kladerna är grenlängderna korta på grund av det lilla antalet fylogenetiskt informativa tecken, och i några få fall är enskilda genträd inkongruenta. Vissa enskilda gener eller kombinationer av gener, såsom glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas och glutaminsyntetas, kan användas för att på ett tillförlitligt sätt skilja de flesta taxa och måste utvecklas som sekundära streckkoder för artnivåidentifiering, vilket är viktigt eftersom många av dessa svampar är av biosäkerhetsbetydelse. Förutom de accepterade arter, anteckningar tillhandahålls för namn där en eventuell nära relation med C. gloeosporioides sensu lato har föreslagits i den senaste litteraturen, tillsammans med alla subspecifika taxa och formae speciales inom C. gloeosporioides och dess förmodade teleomorph Glomerella cingulata.
taxonomiska nyheter: namnbyte-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst. Nya arter-C. aenigma B. Weir & P. R. Johnst., C. aeschynomenes B. Weir & P. R. Johnst., C. alatae B. Weir & P. R. Johnst., C. alienum B. Weir & P. R. Johnst, C. Aotearoa B. Weir & P. R. Johnst., C. clidemiae B. Weir & P. R. Johnst., C. salsolae B. Weir & P. R. Johnst., C. ti B. Weir & P. R. Johnst. Nya underarter-C. kahawae subsp. ciggaro B. Weir & P. R. Johnst. Typifiering: Epitypification-C. queenslandicum B. Weir & P. R. Johnst.
