Podmíněné gene knockout

Podmíněné gene knockout myší jsou často používány pro studium lidských onemocnění, protože mnoho genů produkovat podobné fenotypy u obou druhů. Za posledních 100 let laboratoří myší genetiky byly použity pro toto, protože myši jsou savci, které jsou fyziologicky dostatečně podobné, aby lidé vytvářet kvalitativní testování. Tito dva mají takové podobné geny, že ze 4000 studovaných genů bylo nalezeno pouze 10 u jednoho druhu, ale ne u druhého. Všichni savci sdíleli přibližně stejného společného předka 80 před miliony let; technicky vzato jsou všechny genomy savců poměrně podobné. Ve srovnání mezi myší a lidmi jsou však jejich proteinové kódující oblasti genomů 85% identické a mají podobnosti mezi 99% jejich homologů. Tyto podobnosti vedou k podobným fenotypům, které mají být vyjádřeny mezi těmito dvěma druhy. Jejich geny jsou velmi podobné genům lidí, přičemž 99% má podobné homology. Spolu s produkcí podobných fenotypů je také velmi slibnými kandidáty na podmíněné vyřazení genů. Cílem KOMP je vytvořit knockout mutace v embryonálních kmenových buňkách pro každý z 20 000 genů kódujících proteiny u myší. Geny jsou vyřazeni, protože to je nejlepší způsob, jak studovat jejich funkci a dozvědět se více o jejich roli v lidských nemocí. Existují dvě hlavní strategie podmíněného vyřazení genů, a to cílení na gen nebo homologní rekombinace a zachycení genů. Obě metody mají obvykle modifikovaný virový vektor nebo lineární fragment jako způsob transportu umělé DNA do cílové es buňky. Buňky pak rostou v Petriho misce několik dní a jsou vloženy do embryí v rané fázi. Nakonec jsou embrya umístěna do dělohy dospělé ženy, kde mohou růst na své potomky. Některé alely v tomto projektu nelze vyřadit tradičními metodami a vyžadují specifičnost techniky podmíněného vyřazování genů. K vyřazení posledních zbývajících alel jsou zapotřebí další kombinatorické metody. Podmíněné vyřazení genů je časově náročný postup a existují další projekty zaměřené na vyřazení zbývajících myších genů. Přispěvatel projektu KOMP, Oliver Smithies, pravděpodobně poskytl největší vědecký dopad na toto cílení genů. Oliver obdržel Nobelovu cenu za medicínu kvůli technice umožňující schopnost identifikovat funkce v genech a jak používat metodu “knockout” k odstranění určitých genů. Bohužel průkopník v cílení genů zemřel ve věku 91 let 10. ledna 2017. Projekt byl zahájen v roce 2006 a pokračuje dodnes. Úložiště KOMP poskytuje pobídky těm, kteří se účastní projektů, aby jim vrátili zpětnou vazbu, a těm, kteří splňují specifická kritéria, může být vráceno 50% nákladů na jejich výzkumné buňky.