Ehdollisia geeninkosketuksia
ehdollisia geeninkosketuksia hiirillä käytetään usein ihmisten sairauksien tutkimiseen, koska monet geenit tuottavat samanlaisia fenotyyppejä molemmilla lajeilla. Viimeiset 100 vuotta laboratoriohiirigenetiikkaa on käytetty tähän, koska hiiret ovat nisäkkäitä, jotka ovat fysiologisesti tarpeeksi samanlaisia kuin ihmiset tuottamaan laadullisia testejä. Näillä kahdella on niin samanlaiset geenit, että 4 000 tutkitusta geenistä vain 10 löytyi yhdestä lajista, mutta ei toisesta. Kaikilla nisäkkäillä oli sama yhteinen esi-isä noin 80 miljoonaa vuotta sitten; teknisesti ottaen nisäkkäiden kaikki genomit ovat verrattain samanlaisia. Hiirten ja ihmisten välisessä vertailussa niiden genomien proteiineja koodaavat alueet ovat kuitenkin 85% identtisiä ja niissä on yhtäläisyyksiä 99%: n homologien välillä. Nämä yhtäläisyydet johtavat siihen, että näiden kahden lajin välillä esiintyy samanlaisia fenotyyppejä. Niiden geenit ovat hyvin samanlaisia kuin ihmisillä, 99%: lla homologeista on samanlaisia. Yhdessä tuottaa samanlaisia fenotyyppejä sekä tekee niistä erittäin lupaavia ehdokkaita ehdollisen geenin tyrmäyksiä. Kompin tavoitteena on luoda knockout-mutaatioita alkion kantasoluihin jokaiselle hiirten 20 000 proteiinia koodaavalle geenille. Geenit tyrmätään, koska tämä on paras tapa tutkia niiden toimintaa ja oppia lisää niiden roolista ihmisten sairauksissa. Ehdolliseen geenien tyrmäykseen on kaksi päästrategiaa, ja ne ovat geenien kohdistaminen eli homologinen rekombinaatio ja geenien pyydystäminen. Kummassakin menetelmässä on yleensä muunneltu virusvektori tai lineaarinen fragmentti keinotekoisen DNA: n kuljetusmuotona kohdesoluun. Tämän jälkeen solut kasvavat petrimaljassa useita päiviä, ja ne lisätään varhaisvaiheen alkioihin. Lopuksi alkiot sijoitetaan aikuisen naisen kohtuun, jossa se voi kasvaa jälkeläisekseen. Joitakin alleeleita tässä projektissa ei voida tyrmätä perinteisin menetelmin, ja ne edellyttävät ehdollisen geeninkoutustekniikan spesifisyyttä. Muita kombinatorisia menetelmiä tarvitaan viimeisten jäljellä olevien alleelien tyrmäämiseen. Ehdollinen geenien tyrmäys on aikaa vievä toimenpide, ja on muitakin projekteja, jotka keskittyvät jäljelle jääneiden hiiren geenien tyrmäämiseen. KOMP – projektin rahoittaja Oliver Smithies antoi luultavasti suurimman tieteellisen vaikutuksen tämän geenin kohdistamiseen. Oliver sai Nobelin lääketieteen palkinnon johtuen tekniikasta, joka mahdollistaa kyvyn tunnistaa geenien toimintoja ja miten “knockout” – menetelmää käytetään tiettyjen geenien poistamiseen. Valitettavasti geenien kohdentamisen pioneeri kuoli 91-vuotiaana 10. tammikuuta 2017. KOMP-ennuste aloitettiin vuonna 2006 ja se jatkuu edelleen. KOMP-tietokanta tarjoaa hankkeisiin osallistuville kannustimia palauttaakseen palautetta, ja niille, jotka täyttävät tietyt kriteerit, voidaan palauttaa 50% tutkimussolujen kustannuksista.
