Warunkowy knockout genu

warunkowe knockouty genu u myszy są często używane do badania chorób ludzkich, ponieważ wiele genów wytwarza podobne fenotypy u obu gatunków. Przez ostatnie 100 lat laboratoryjne genetyki myszy były wykorzystywane do tego, ponieważ myszy są ssakami, które są fizjologicznie podobne do ludzi, aby generować testy jakościowe. Te dwa mają tak podobne geny, że z 4000 badanych genów tylko 10 zostało znalezionych w jednym gatunku, ale nie w drugim. Wszystkie ssaki miały wspólnego przodka około 80 milionów lat temu; technicznie rzecz biorąc, wszystkie genomy ssaków są stosunkowo podobne. Jednak w porównaniu między myszami i ludźmi, ich regiony kodujące białka genomów są w 85% identyczne i mają podobieństwa między 99% ich homologów. Podobieństwa te skutkują zbliżonymi fenotypami obu gatunków. Ich geny są bardzo podobne do genów ludzkich, a 99% ma homologi podobne. Wraz z wytwarzaniem podobnych fenotypów, jak również czyni je bardzo obiecującymi kandydatami do warunkowych knockoutów genowych. Celem KOMP jest stworzenie nokautujących mutacji w embrionalnych komórkach macierzystych dla każdego z 20 000 genów kodujących białko u myszy. Geny są znokautowane, ponieważ jest to najlepszy sposób, aby zbadać ich funkcję i dowiedzieć się więcej o ich roli w ludzkich chorobach. Istnieją dwie główne strategie warunkowego knockoutu genu, a są to celowanie genów lub rekombinacja homologiczna i pułapkowanie genów. Obie metody zwykle mają zmodyfikowany wektor wirusowy lub liniowy fragment jako sposób transportu sztucznego DNA do docelowej komórki ES. Następnie komórki rosną w szalce Petriego przez kilka dni i są wprowadzane do zarodków we wczesnym stadium. Na koniec zarodki są umieszczane w macicy dorosłej samicy, gdzie może wyrosnąć na jej potomstwo. Niektóre allele w tym projekcie nie mogą być znokautowane przy użyciu tradycyjnych metod i wymagają specyfiki warunkowej techniki knockout genu. Inne kombinatoryczne metody są potrzebne, aby znokautować Ostatnie allele. Warunkowy nokaut genów jest czasochłonną procedurą i istnieją dodatkowe projekty skupiające się na wykorzenieniu pozostałych genów myszy. Współpracownik projektu Komp, Oliver Smithies, prawdopodobnie dostarczył największy naukowy wpływ na celowanie tego genu. Oliver otrzymał Nagrodę Nobla w dziedzinie medycyny ze względu na technikę pozwalającą na identyfikację funkcji w genach i jak używać metody “knockout” do usuwania niektórych genów. Niestety, pionier w kierowaniu genami zmarł w wieku 91 lat 10 stycznia 2017 roku. Projekt KOMP rozpoczął się w 2006 roku i trwa do dziś. Repozytorium KOMP stanowi zachętę dla osób uczestniczących w projektach do zwracania im informacji zwrotnych, a tym, którzy spełniają określone kryteria, można zwrócić 50% kosztów swoich komórek badawczych.