Villkorlig genknockout

villkorlig genknockout hos möss används ofta för att studera mänskliga sjukdomar eftersom många gener producerar liknande fenotyper i båda arterna. Under de senaste 100 åren har laboratoriemusgenetik använts för detta eftersom möss är däggdjur som är fysiologiskt lika nog för människor för att generera kvalitativ testning. Dessa två har sådana liknande gener att av 4000 studerade gener hittades endast 10 i en art men inte den andra. Alla däggdjur delade samma gemensamma förfader ungefär 80 miljoner år sedan; tekniskt sett är alla genom av däggdjur relativt lika. Men i jämförelse mellan möss och människor är deras proteinkodande regioner i genomerna 85% identiska och har likheter mellan 99% av deras homologer. Dessa likheter resulterar i att liknande fenotyper uttrycks mellan de två arterna. Deras gener är mycket lika de hos människor med 99% som har homologer som liknar. Tillsammans med att producera liknande fenotyper och göra dem mycket lovande kandidater för villkorliga genknockouts. Målet med KOMP är att skapa knockout-mutationer i de embryonala stamcellerna för var och en av de 20 000 proteinkodande generna hos möss. Generna slås ut eftersom detta är det bästa sättet att studera deras funktion och lära sig mer om deras roll i mänskliga sjukdomar. Det finns två huvudstrategier för villkorlig genknockout och de är geninriktning eller homolog rekombination och genfångning. Båda metoderna har vanligtvis en modifierad viral vektor eller ett linjärt fragment som transportsätt för det artificiella DNA i mål-ES-cellen. Cellerna växer sedan i en petriskål i flera dagar och sätts in i embryon i tidigt stadium. Slutligen placeras embryona i den vuxna kvinnans livmoder där den kan växa till sin avkomma. Vissa alleler i detta projekt kan inte slås ut med traditionella metoder och kräver specificiteten hos den villkorliga genknockout-tekniken. Andra kombinatoriska metoder behövs för att slå ut de sista kvarvarande allelerna. Villkorlig genknockout är en tidskrävande procedur och det finns ytterligare projekt som fokuserar på att slå ut de återstående musgenerna. Komp-projektets bidragsgivare, Oliver Smithies, gav utan tvekan den största vetenskapliga inverkan på denna geninriktning. Oliver fick Nobelpriset för medicin på grund av en teknik som möjliggör förmågan att identifiera funktioner i gener och hur man använder ‘knockout’ – metoden för att radera vissa gener. Tyvärr dog pionjären inom geninriktning vid 91 års ålder den 10 januari 2017. KOMP-projektet startades 2006 och pågår fortfarande idag. KOMP-arkivet ger incitament till dem som deltar i projekten för att returnera feedback till dem och de som uppfyller specifika kriterier kan återbetalas 50% av kostnaden för sina forskningsceller.